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深水埗区共有38所中学，包括23所资助、4所私立、8所直资、1所公立、2所国际。以下为完整学校列表，点击校名查看详情。
| 学校名称 | 类别 | 课程 | 学费 | 地址 |
|---|---|---|---|---|
| 德贞女子中学 | 资助 | — | 免费 | 九龙深水埗兴华街西9号及5楼513 514 515及516室 |
| 香港四邑商工总会黄棣珊纪念中学 | 资助 | — | 免费 | 九龙南昌街250号 |
| 宝血会上智英文书院 | 资助 | — | 免费 | 九龙石硖尾伟智街3号 |
| 路德会协同中学 | 资助 | — | 免费 | 九龙大坑东道12号 |
| 德雅中学 | 资助 | — | 免费 | 九龙又一邨达之路18号 |
| 佛教大雄中学 | 资助 | — | 免费 | 九龙苏屋深水埗长发街38号 |
| 圣母玫瑰书院 | 资助 | — | 免费 | 九龙又一村玫瑰街22号 |
| 圣公会圣马利亚堂莫庆尧中学 | 资助 | — | 免费 | 九龙深水埗海丽街1号 |
| 保良局唐乃勤初中书院 | 资助 | — | 免费 | 九龙深水埗美荔道11号 |
| 厂商会中学 | 资助 | — | 免费 | 九龙白田南昌街298号 |
| 中华基督教会铭贤书院 | 资助 | — | 免费 | 九龙石硖尾伟智街1号 |
| 东华三院张明添中学 | 资助 | — | 免费 | 九龙深水埗南昌街300号 |
| 玛利诺神父教会学校 | 资助 | — | 免费 | 九龙深水埗桃源街2号 |
| 长沙湾天主教英文中学 | 资助 | — | 免费 | 九龙长沙湾福荣街533号 |
| 天主教南华中学 | 资助 | — | 免费 | 九龙深水埗永明街5号 |
| 香港红十字会医院学校(中学部) | 资助 | — | 免费 | 九龙荔枝角玛嘉烈医院路2-10号玛嘉烈医院(主楼地下及G座、K座和M座1楼职业治疗部除外) |
| 东华三院群芳启智学校(中学部) | 资助 | — | 免费 | 九龙大坑东南山邨道28号 |
| 路德会救主学校(中学部) | 资助 | — | 免费 | 九龙深水埗大埔道288号 |
| 明爱赛马会乐仁学校(中学部) | 资助 | — | 免费 | 九龙深水埗永康街121号 |
| 香港扶幼会则仁中心学校(中学部) | 资助 | — | 免费 | 九龙深水埗歌和老街47号 |
| 中华基督教会望觉堂启爱学校(中学部) | 资助 | — | 免费 | 九龙深水埗深旺道110号 |
| 香港扶幼会-许仲绳纪念学校(中学部) | 资助 | — | 免费 | 九龙深水埗东沙岛街150号 |
| 香港心理衞生会-臻和学校(中学部) | 资助 | — | 免费 | 九龙深水埗歌和老街53号(包括1楼及2楼B4 B6 B17 B19室用作宿舍) |
| 汇基书院 | 私立 | 双轨（本地+国际） | 免费 | 九龙大坑东棠荫街9及11号 |
| 圣玛加利男女英文中小学 | 直资 | 双轨（本地+国际） | HKD 4.7万/年 | 九龙深水埗深旺道33号 |
| 基督教崇真中学 | 直资 | 双轨（本地+国际） | HKD 4.3万 – 5.3万/年 | 九龙深水埗荔康街8号及新翼大楼 |
| 地利亚修女纪念学校﹝百老汇﹞ | 直资 | 本地课程（DSE） | 最高 HKD 3,000/年 | 九龙美孚新邨百老汇街80-86号 |
| 地利亚修女纪念学校(吉利径) | 直资 | 本地课程（DSE）、IB | 最高 HKD 3万/年 | 九龙美孚新邨吉利径1-3号 |
| 惠侨英文中学 | 直资 | 本地课程（DSE） | HKD 3,000 – 3,200/年 | 九龙石硖尾伟智街17号 |
| 中圣书院 | 直资 | 本地课程（DSE） | HKD 4,430 – 9,800/年 | 九龙深水埗怀惠道18号 |
| 英华书院 | 直资 | 双轨（本地+国际） | HKD 2.5万 – 5.8万/年 | 九龙深水埗英华街1号 |
| 香岛中学 | 直资 | 本地课程（DSE） | HKD 6,130 – 1.1万/年 | 九龙大坑东桃源街33号 |
| 九龙工业学校 | 公立 | — | 免费 | 九龙长沙湾道332-334号 |
| 宣道国际学校 | 国际 | 加拿大课程、IB、AP 课程 | HKD 20.5万 – 23.7万/年 | 九龙长沙湾琼林街33号教学大楼及停车场 |
| 协同国际学校 | 国际 | 美国课程、AP 课程 | HKD 12.9万 – 15.1万/年 | 九龙又一村海棠路68号 |
| 圣道百卉书院 | 私立 | 本地课程（DSE）、英国课程、美国课程 | HKD 20.3万 – 21.7万/年 | 九龙大坑东棠荫街15号 |
| 保良局蔡继有学校 | 私立 | IB | HKD 14.5万 – 14.7万/年 | 九龙深水埗郝德杰道6号 |
| 路德会吕祥光夜中学 | 私立 | 本地课程（DSE） | 免费 | 九龙长沙湾道332—334号九龙工业学校311—315室及407—411室(2021／22学年至2025／26学年逢星期一至星期五晚上六时四十五分至九时四十五分) |